V průběhu výběrového řízení došlo k administrativně-organizačním a procesním změnám v důsledku legislativního výkladu metodickými útvary MV ČR zejména:
- veškeré požadavky na úpravy EKIS SAP a rozvojové požadavky řeší ZSMV resp. zpracovatel veřejné zakázky výhradně s odbornými útvary MVČR a vlastní úpravy v programu SAP provádí programátoři České pošty a.s.,
- legislativní úpravy kontrolního hlášení DPH,
- zrušení povinnosti zavést registrační pokladny pro příspěvkové organizace,
- změna ve způsobu poskytování služeb (osobní přítomnost zpracovatele na pracovištích ZSMV),
- odklad implementace modulu PM (opravy majetku),
- odstoupení od řešení elektronické evidence a správy pohledávek v elektronickém systému SAP.

Na základě těchto nových skutečností nelze pokračovat ve veřejné zakázce v rozsahu, v jakém byla vyhlášena. S ohledem na výše uvedené je nutné předefinovat rozsah oblastí poskytovaných služeb a stanovit doplňující kritéria do nového zadání veřejné zakázky.